Hoe om die LOD telling te bereken
Die LOD telling, of logaritmes
conținut
stappe

1
Daar is twee gevalle om die LOD telling te bereken. Die mees gebruikte is wanneer jy `n klein aantal nageslag het. Gebruik dan die volgende metode wat genoem word "wanneer die grootte van die nageslag klein is". As die grootte van die nageslag klein is en jy glo dat die aantal rekombinante en nie-rekombinante wat presies die genetiese afstand tussen twee gene verteenwoordig (wat skaars is in die menslike genetika), gebruik die metode onder die titel "wanneer die grootte van die nageslag groot is" .
Metode 1
Wanneer die nageslag klein is

1
Dit veronderstel `n sekere genetiese afstand tussen twee gene (tussen 0 en 0 en 50 cM). Gestel jy neem die genetiese afstand (r) as 0.1.

2
Dit neem aan dat dit 13 mense het waarvan 2 rekombinante is. Die waarskynlikheid van nie-rekombinante sal 1-r = 1-0.1 = 0.9 wees

3
As jy elke genotipe wil volg, verdeel dit met 2: (1-r) / 2 = 0,45. Die waarskynlikheid van die rekombinante sal r / 2 = 0.1 / 2 = 0.05 wees





4
Herhaal hierdie proses vir r as 0, 0.01, 0.03, 0.05, 0.3 en 0.5.

Metode 2
Wanneer die grootte van die nageslag groot is

1
Vestig `n stamboom vir twee plekke van belang. Hoe meer data jy versamel, hoe beter.

2
Bepaal die aantal rekombinante en die aantal nie-rekombinante. Byvoorbeeld, dit word aanvaar dat allele A1 en B1 in plek 1 van een ouer kom, en allele A1 en B2 in plek 2 kom van die ander. Erfenis van A2B2 A1B1 of rekombinante nageslag is nie, terwyl erfenis van A1B2 of A2B1 progiene is rekombinante.

3
Bereken die waarskynlikheid om die resultate te verkry as die twee loci gekoppel word. Dit word gegee deur ((R / (R + NR)) ^ R) * ((1- (R / (R + NR))) ^ NR), waar R = aantal recombinants, NR = aantal nie-rekombinante.




4
Bereken die waarskynlikheid om die resultate te verkry as die twee loci gekoppel word. Hulle word gegee deur 0.5 ^ (NR + R). In die vorige voorbeeld is dit 0,5 ^ (64 + 36) = 0.5 ^ 100 = 7.88860905 × 10 ^ -31.

5
Die verdeling van die waarskynlikheid van die verkryging van die resultate in die veronderstelling dat die twee loci gekoppel (uit stap 3 hierbo), is die waarskynlikheid van die verkryging van die resultate in die veronderstelling dat die twee loci is ontkoppel (stap 4 hierbo). Byvoorbeeld, dit is gelyk aan 4.19187538 * 10 ^ -29 / 7.88860905 × 10 ^ -31 = 53.14.

6
Neem die basis 10 logaritme van die vorige verwerf verhouding (stap 5). Byvoorbeeld, log 53,14 is 1,73.
wenke
- Vir die interpretasie van die LOD-telling word `n LOD-telling van meer as 3,0 beskou as afleidingsbewyse. `N LOD telling van +3 dui daarop dat 1000 tot 1 waarskynlikhede dat die waargenome skakeling nie toevallig gebeur het nie. Aan die ander kant word `n LOD-telling van minder as -2.0 as bewys beskou om `n skakeling uit te sluit. In die vorige voorbeeld, die LOD telling +1.73, word die skakel aanvaar maar nie bevestig nie. Groter aantal data punte sal die LOD telling verhoog indien die koppeling deur analise bestaan.
Dinge wat jy nodig het
- sakrekenaar
Deel op sosiale netwerke:
Verwante
Hoe om Snapchat se telling vinnig te verhoog
Hoe om persentasie in Java te bereken
Hoe om met die dobbelsteen te wen
Hoe speel yahtzee
Hoe om jou gholfgebrek te bereken
Hoe om die tennis telbord te neem
Hoe om punte in gholf te hou
Hoe om `n Punnett boks te maak
Hoe om die tennis telling in Frans te neem
Hoe om `n eksamengraad te bereken
Hoe om die kans van verskeie dobbelstene te bereken
Hoe om jou finale graad te bereken
Hoe om `n waarskynlikheid te bereken
Hoe om 10 in Engels te tel
Hoe om te tel tot 10 in Brasiliaanse Portugees
Hoe om die helling te verstaan (in algebra)
Hoe om statistiese betekenisvolheid te evalueer
Hoe om die waarskynlikheid van nodale betrokkenheid by indringende borskanker te bereken
Hoe om Z tellings te bereken
Hoe om 10 in Duits te tel
Hoe om tien te tel in Pools